Protein–RNA interactions for Protein: Q8K057

Ift80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift80Q8K057 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift80Q8K057 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms