Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms