Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms