Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopaQ8CIE6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms