Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms