Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms