Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp2Q8CGR7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms