Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc43a2Q8CGA3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms