Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms