Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp27Q8CEG8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms