Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pramef8Q8CE24 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pramef8Q8CE24 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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