Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms