Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrebrfQ8CDG5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms