Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa8Q8CC88 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms