Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfibp1Q8C8U0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms