Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms