Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp38Q8BW70 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp38Q8BW70 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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