Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubr7Q8BU04 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms