Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy4Q8BQ47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy4Q8BQ47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms