Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms