Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms