Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smarcal1Q8BJL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms