Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup107Q8BH74 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup107Q8BH74 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms