Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl1Q8BH66 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms