Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms