Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms