Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms