Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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IfneQ80ZF2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfneQ80ZF2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms