Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc27Q80YS5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc27Q80YS5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc27Q80YS5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc27Q80YS5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc27Q80YS5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc27Q80YS5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms