Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms