Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp8Q80U87 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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