Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms