Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms