Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms