Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms