Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf18Q7TS55 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf18Q7TS55 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tnfsf18Q7TS55 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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