Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg4Q7TMD7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg4Q7TMD7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms