Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn4bQ7M729 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4bQ7M729 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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