Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trappc6aQ78XR0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc6aQ78XR0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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