Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms