Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme8Q715T0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms