Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms