Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms