Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms