Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms