Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb3Q6XAS4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb3Q6XAS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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