Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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