Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc44a1Q6X893 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms