Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rhox8Q6VSS7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rhox8Q6VSS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms