Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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